邢风一个出色的神奇宝贝训练家，就在石英高原的比拼当中，用皮卡丘来和对方的耿鬼进行最后的对决。不料两方发出光线撞击太过强烈导致空间扭曲形成漏洞，他和自己的皮神皮卡丘来到了各种的异世界。每个异世界都有扇通往下个异世界的大门，需要三件信物才可以打开大门，通过这些大门才有可能回到自己原来的世界之中。